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。自荣三爷主政市府以来，孙晋大部分时间放在阜新制药厂上，经常到各个车间视察作业流程，与车间师傅聊天，与工人们同吃一桌；了解那些外国技师的想法和建议。通过一段时间深入调查，孙晋还是发现不少问题，特别是原材料损耗太大，次品增多，浪费了不少药材和时间，生产效率低下。孙晋把主管生产的掌柜找来问，负责生产掌柜的是不可能啊，这已经是高效生产啊，若是药房手工制作更慢啦！孙晋后来找到荣三爷到此事，荣三爷也是吃惊，孙晋还不知足啊，这已经是相当快了。孙晋后来一想，才明白是怎么回事：时代眼光不一样了。荣三爷和生产掌柜的认为机械生产比药房手工制作快了不知多少倍，但孙晋是用前世眼光看待的，见过大企业生产效益，相比较之下，觉得东北药业现在浪费挺大的，要不是市场供不应求，利润绝对会下降。
通过孙晋不断细致的探索，与工人师傅一同研究如何提高生产效率，大家你一言我一句的献计献策，从各个生产环节细致入手，杜绝人工操作人为因素，制定各种操作细节规范，完善岗位职责、奖罚制度和工人的福利制度，既保证了生产效率的提高，又做好秘方的保护工作。孙晋想起以前有部电视连续剧《大染坊》，陈寿亭不用温度计测试水温用鱿鱼试，堵住无孔不入的间谍的窥探。
东北药业实验室主管**曾告诉孙晋，传统药物方剂的组成有君臣佐使四类药物；所谓“君臣佐使”，即从多元用药的角度，论述各药在方中的地位及配伍后的性效变化规律。它高度概括了中医遣药组方的原则，是七情配伍的进一步发展，对学习研究中药成方和指导临床合理用药具有极其重要的意义。
1、君药：即在处方中对处方的主证或主病起主要治疗作用的药物。它体现了处方的主攻方向，其药力居方中之首，是组方中不可缺少的药物。
2、臣药：是辅助君药加强治疗主病和主证的药物。
3、佐药：意义一是为佐助药，用于治疗次要兼证的药物，二是为佐制药，用以消除或减缓君药、臣药的毒性或烈性的药物，三是为反佐药，即根据病情需要，使用与君药药性相反而又能在治疗中起相成作用的药物。
4、使药：意义一是引经药，引方中诸药直达病所的药物，二是调和药，即调和诸药的作用，使其合力祛邪。
如世界有名的云南白药，这副方剂一般人不知道，只是有人猜测三七是主药。后世日本人曾有显微仪器、光学原理对云南白药进行观察，但是就是没有发现这副方剂的具体成分和配制，云南白药药方和制作工艺被国家列为最高机密保护。这就是中药的魅力。
而中药材制成西药，就得是运用中药化学即是一门结合中医药基本理论和临床用药经验，主要运用化学的理论和方法及其它现代科学理论和技术等研究中药化学成分的学科。比如这个板蓝根注射液，板蓝根中药成分的一般提取、分离方法，结构测定的一般程序；研究中药化学成分时，提取、分离、鉴定是必不可少的三个步骤。首先是把化学成分从药材中提取出来，其产物含多种成分，即为复杂的混合物，然后经过初步分离纯化及进一步分离得到达到一定纯度的单体成分，才能进行结构鉴定。板蓝根注射液提取法主要分为水蒸气蒸馏法；这个水蒸气蒸馏法关键的要掌握这个温度和水压，否则全功尽弃。
孙晋根据这个原理，在制药设备上做文章：要求设备厂家将衡量温度和水压的指示针和数字进行修改。比如提取板蓝根主药化学成分需要120度，超过低于皆不行。孙晋在温度显示器上只有10度、50度……100度，没根本就没有120度数字；原因是孙晋利用前世进修过机械制造的知识，拜访了不少专家教授特制这个温度显示表。当温度指示针到达100度位置时，其实制造设备的温度已经是120度了，当别人用100度提取时也就提取不出来了。再加上这个岗位的工作人员都是信得过的，即使被别人拉下水也没关系，你只能知道是100度，等待饿结果注定是失败的。因为知道这个秘密只有实验室和孙晋、荣三爷等几个人。这也是孙晋不担心秘方泄露的原因。
经过孙晋与各位技师、师傅、工人不断努力探索与实践，东北药业也研制了一套比较成熟制药行业流程，将技术、机械设备、人力三者紧紧连在一起，形成良性的生产流程图，东北药业生产效率迅速提高，利润也是水涨船高了。现在孙晋感到最紧迫的是急需大量的医学化学生物学的人才，特别是化学。但是数理生物化医这些自然学科又是急不得，需要层层递进的学习再学习。
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